MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 7734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_022784	GAG	2	6	1047539	1047544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_022784	CA	3	6	1047581	1047586	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7003	NC_022784	GA	3	6	1047594	1047599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_022784	CCA	2	6	1047612	1047617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7005	NC_022784	CCGG	2	8	1047619	1047626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7006	NC_022784	GAT	2	6	1047668	1047673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_022784	GTG	2	6	1047704	1047709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_022784	G	6	6	1047716	1047721	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_022784	GAC	2	6	1047743	1047748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_022784	TGG	2	6	1047818	1047823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_022784	CA	3	6	1047826	1047831	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7012	NC_022784	TAG	2	6	1047873	1047878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_022784	GCA	2	6	1047914	1047919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_022784	CCA	2	6	1048066	1048071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7015	NC_022784	CTT	2	6	1048106	1048111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_022784	CCA	2	6	1048380	1048385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7017	NC_022784	TAC	2	6	1048529	1048534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_022784	GA	3	6	1048542	1048547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_022784	GCAAT	2	10	1048620	1048629	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7020	NC_022784	GAA	2	6	1048721	1048726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_022784	CCG	2	6	1048811	1048816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7022	NC_022784	CAG	2	6	1048823	1048828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_022784	ATA	2	6	1048877	1048882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_022784	GCA	2	6	1048912	1048917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_022784	CAT	2	6	1049038	1049043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_022784	CTA	2	6	1049056	1049061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_022784	CTG	2	6	1049062	1049067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_022784	AGC	2	6	1049183	1049188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_022784	TAA	2	6	1049201	1049206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_022784	GGA	2	6	1049214	1049219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_022784	TGC	2	6	1049338	1049343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_022784	GCAGA	2	10	1049344	1049353	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7033	NC_022784	CACC	2	8	1049405	1049412	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7034	NC_022784	AGC	2	6	1049416	1049421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_022784	AAC	2	6	1049593	1049598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7036	NC_022784	GT	3	6	1049630	1049635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_022784	ACA	2	6	1049670	1049675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_022784	GCT	2	6	1049700	1049705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_022784	AGC	2	6	1049722	1049727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_022784	CAA	2	6	1049744	1049749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_022784	N	155	155	1049839	1049993	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_022784	ACA	2	6	1050022	1050027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_022784	GCT	2	6	1050052	1050057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_022784	AGC	2	6	1050074	1050079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_022784	CAA	2	6	1050096	1050101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_022784	TTG	2	6	1050280	1050285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_022784	GC	3	6	1050291	1050296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7048	NC_022784	TGT	2	6	1050577	1050582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_022784	CAG	2	6	1053769	1053774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_022784	CTTTG	2	10	1054438	1054447	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7051	NC_022784	ACA	2	6	1054481	1054486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_022784	GCCT	2	8	1054786	1054793	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7053	NC_022784	CCA	2	6	1054846	1054851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7054	NC_022784	AGC	2	6	1054868	1054873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_022784	ACC	2	6	1054883	1054888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7056	NC_022784	CAA	2	6	1057282	1057287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7057	NC_022784	A	6	6	1057307	1057312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_022784	TCA	2	6	1057632	1057637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_022784	CT	3	6	1057656	1057661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7060	NC_022784	TTCC	2	8	1057684	1057691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7061	NC_022784	ACA	2	6	1057716	1057721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_022784	GCG	2	6	1057736	1057741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_022784	CA	3	6	1057747	1057752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7064	NC_022784	TGT	2	6	1057783	1057788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_022784	ATGG	2	8	1057895	1057902	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_022784	AGC	2	6	1057935	1057940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7067	NC_022784	TCA	2	6	1057957	1057962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_022784	C	6	6	1058045	1058050	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7069	NC_022784	TA	3	6	1058060	1058065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_022784	CCG	2	6	1058100	1058105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7071	NC_022784	GCA	2	6	1058199	1058204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_022784	ATTAA	2	10	1058212	1058221	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_022784	TGCA	2	8	1058239	1058246	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7074	NC_022784	ACC	2	6	1058251	1058256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7075	NC_022784	GTT	2	6	1058268	1058273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_022784	ATGC	2	8	1058298	1058305	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7077	NC_022784	GA	3	6	1058414	1058419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_022784	T	6	6	1058420	1058425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_022784	TGC	2	6	1058452	1058457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7080	NC_022784	CAG	2	6	1058474	1058479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7081	NC_022784	GTAT	2	8	1058485	1058492	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_022784	TCC	2	6	1058632	1058637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7083	NC_022784	CAT	2	6	1058678	1058683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7084	NC_022784	TTCG	2	8	1061480	1061487	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7085	NC_022784	CAC	2	6	1061488	1061493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7086	NC_022784	TGC	2	6	1061516	1061521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7087	NC_022784	TGCA	2	8	1061606	1061613	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7088	NC_022784	CAT	2	6	1061678	1061683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7089	NC_022784	GTAC	2	8	1061698	1061705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7090	NC_022784	GCG	2	6	1061731	1061736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7091	NC_022784	CAA	2	6	1061764	1061769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7092	NC_022784	GCA	2	6	1061841	1061846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7093	NC_022784	TGGG	2	8	1061879	1061886	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_022784	TG	3	6	1061922	1061927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_022784	ACA	2	6	1061998	1062003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7096	NC_022784	GTAG	2	8	1062004	1062011	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_022784	CCG	2	6	1062027	1062032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7098	NC_022784	GCA	2	6	1062120	1062125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7099	NC_022784	TAAG	2	8	1062147	1062154	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_022784	TACCA	2	10	1062266	1062275	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7101	NC_022784	ACA	2	6	1062289	1062294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_022784	CTA	2	6	1062393	1062398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_022784	CA	4	8	1062502	1062509	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7104	NC_022784	AGTA	2	8	1064211	1064218	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_022784	GA	3	6	1064263	1064268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_022784	GC	3	6	1064291	1064296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7107	NC_022784	T	6	6	1064318	1064323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_022784	GCA	2	6	1064435	1064440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_022784	CG	3	6	1064441	1064446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7110	NC_022784	AAG	2	6	1064475	1064480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_022784	GATC	2	8	1064522	1064529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7112	NC_022784	CTG	2	6	1064611	1064616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7113	NC_022784	CATGT	2	10	1065131	1065140	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7114	NC_022784	GGC	2	6	1065146	1065151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7115	NC_022784	GC	3	6	1065193	1065198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7116	NC_022784	AG	3	6	1065213	1065218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_022784	GCA	2	6	1065245	1065250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7118	NC_022784	CT	3	6	1065414	1065419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7119	NC_022784	AAG	2	6	1065456	1065461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_022784	ACG	2	6	1065673	1065678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7121	NC_022784	TGG	2	6	1066997	1067002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_022784	CAT	2	6	1067003	1067008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7123	NC_022784	GTT	2	6	1067041	1067046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_022784	ATG	2	6	1067047	1067052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_022784	TGC	2	6	1067092	1067097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7126	NC_022784	GCT	2	6	1067123	1067128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7127	NC_022784	TAC	2	6	1067131	1067136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7128	NC_022784	TCC	2	6	1068205	1068210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7129	NC_022784	ACT	2	6	1068255	1068260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7130	NC_022784	ATT	2	6	1068327	1068332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7492	NC_022784	GCA	2	6	1134331	1134336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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